Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms