Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms