Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms