Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930402K13RikB1AW18 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms