Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms