Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms