Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramel3A2AHA7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms