Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms