Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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