Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms