Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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