Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim10Q9WUH5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 742.6 ms