Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms