Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc2Q9R244 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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