Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NrkQ9R0G8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms