Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Wdr54Q9R0D8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms