Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nek3Q9R0A5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms