Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp11cQ9QZW0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms