Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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