Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms