Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms