Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Limd1Q9QXD8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Limd1Q9QXD8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Limd1Q9QXD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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