Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dkk3Q9QUN9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms