Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf1Q9JM58 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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