Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabgef1Q9JM13 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Rabgef1Q9JM13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rabgef1Q9JM13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabgef1Q9JM13 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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