Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms