Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ybx3Q9JKB3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ybx3Q9JKB3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms