Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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