Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp29Q9ES63 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp29Q9ES63 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms