Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms