Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dap3Q9ER88 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms