Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms