Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf6Q9DBU5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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