Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms