Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Samd8Q9DA37 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms