Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms