Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms