Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms