Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms