Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms