Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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