Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms