Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms