Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rfc5Q9D0F6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc5Q9D0F6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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