Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms