Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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