Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms