Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms