Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms