Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms